Samostalni sektor za suzbijanje korupcije uspostavlja, promiče i obavlja suradnju nositelja provedbe mjera suzbijanja korupcije. Pomaže i podupire nositelje provedbe mjera u cilju suzbijanja korupcije; sastavlja godišnja izvješća o provedbi mjera nacionalnih, strateških i provedbenih dokumenata te ih upućuje na raspravu u Hrvatski sabor.
Surađuje s Nacionalnim vijećem za praćenje provedbe Strategije suzbijanje korupcije; obavlja stručne i administrativne poslove za Povjerenstvo za praćenje provedbe mjera za suzbijanje korupcije; potiče primjenu europskih i drugih međunarodnih politika suzbijanja korupcije; prati provedbu preporuka Skupine država protiv korupcije (GRECO).
Sudjeluje u aktivnostima koje proizilaze iz primjene Konvencije Ujedinjenih naroda protiv korupcije, Kaznenopravne konvencije Vijeća Europe o korupciji i njezinog Dodatnog protokola te Građanskopravne konvencije Vijeća Europe o korupciji.
Surađuje s javnim sektorom, privatnim sektorom i jednicama lokalne i područne (regionalne) samouprave i sudjeluje u izradi i praćenju njihovih mini akcijskih planova suzbijanja korupcije; sudjeluje u programima podizanja javne svijesti i obrazovanja o štetnosti korupcije.
Obavlja poslove izrade promotivnih letaka i brošura; uspostavlja, unaprjeđuje i promovira suradnju s organizacijama civilnog društva u cilju trajnog savjetovanja između organizacija civilnog društva i nositelja mjera nacionalnih strateških i provedbenih dokumenata.
Prikuplja i analizira podatke o provedbi Strategije suzbijanja korupcije; obavlja poslove izrade mjera za pripadajuće akcijske planove; izrađuje posebna izvješća o zakonodavnom okviru i trendovima suzbijanja korupcije sa statističkim podacima za pojavne oblike korupcije.
Provodi sustavnu analizu institucionalnog i zakonodavnog okvira, načina prevencije i zaštite »zviždača«; provodi istraživanje o rasprostranjenosti i uzrocima korupcije.
Radi na prikupljanju, analizi i objavi svih važnih podataka vezanih uz suzbijanje korupcije, prati statističke podatke o procesuiranju koruptivnih kaznenih djela, prikuplja i analizira pravomoćne presude.
Središnje je mjesto za ujednačavanje i razmjenu podataka o suzbijanju korupcije između svih relevantnih tijela na nacionalnoj razini; razvija nove načine prikupljanja statističkih podataka; priprema materijale za ministra i druge članove Vlade Republike Hrvatske o suzbijanju korupcije; obavlja i druge poslove koje mu povjeri ministar.
Djelokrug rada Samostalnog sektora za suzbijanje korupcije propisan je Uredbom o unutarnjem ustrojstvu Ministarstva pravosuđa „NN“ 28/2012.